自2015年{{中國藥典}}頒布后，中藥材質量問題百出，重金屬超標、農殘超標、硫磺超標、黃曲霉素超標、灰分超標，以及有效含量不合格等，成為影響藥材質量的首要問題。究其原因，影響中藥材質量的根源在哪？
影響中藥材質量的因素很多，從中藥材種植、管理、采收、初加工、儲藏以及銷售等過程，都是影響中藥材質量的重要環節。為了提高藥材質量，必須找出影響質量的關鍵問題，
中藥材種植管理不科學
中藥材生長對土壤、光照、溫度、水分等自然環境的要求，往往有所差異。如：芍藥適宜溫暖濕潤氣候條件，具有喜光、喜溫、喜肥和一定的耐寒特性。在年均溫14.5度、7月均溫27.8度、極端較高溫42.1度的條件下生長良好。芍藥一般多生長在土層深厚、質地疏松、排水良好的壤土或砂壤土。可是，種苗商販竟然在江西、河南、青海等地大力推廣種植，并宣傳芍藥種植不擇土壤、氣候，南北均適宜栽種。然而，這些貨源較終拉到亳州市場銷售，經用藥單位檢測，含芍藥苷遠遠低于藥典1.2％的標準。
在藥材種植中，正常情況下栽種一畝藥材需要一袋復合肥（50公斤）和一袋磷肥（50公斤），但是，有的種植戶為提高產量，加大施肥量，一畝藥材用了3袋復合肥和4袋磷肥，難怪產出的藥材重金屬超標。還有的種植戶為提高產量，噴施膨大劑、狀根靈等藥物，產出的藥材質量咋能不出問題。同時，在中藥材生長期間管理也不科學，為防治病蟲害，一遍遍地噴施農藥，所產藥材農殘怎能不超標。
中藥材采收不科學
中藥材的合理采收（季節、時間、方法），不僅對保證藥材的質量、藥效，而且還對保護、擴大藥源具有重要意義。俗話說：“二月茵陳三月蒿，五月茵陳當柴燒。”說明中藥材的采收季節性是很嚴格的。如麻黃含生物堿之量以8-9月為高，故采集宜于8-9月；番瀉葉以生長90天左右者含蒽醌類活性成分較高，宜此時采集；天麻以冬季莖花未出土時采集之冬麻質重效佳，花莖出土所采之春麻次之，中藥材采收應在有效成分含量較高時。
有些藥材采收需要到一定的生長年限，過早或者推遲采收多會影響有效含量。如：白芍需生長4-5年后采挖，前幾年白芍漲價時有種植戶把生長3年的都采挖出來了，近幾年白芍價格下滑，有的種植戶就推遲了采挖時間，生長5年的到第6年才采挖。
也有的藥材采收有很強的季節性，如：薄荷在生長初期不含薄荷腦，而在開花末期，薄荷腦的含量才急劇增加；又如杜仲，要在定植15-20年后剝皮，質量才符合藥典規定的要求。因此，合理、適時采收中藥材，不僅要考慮到單位面積的產量，而且還要了解藥植生長發育特性、生長年限、有效成分積累變化規律，才能達到優質高產之目的。可是，有的藥農為趕行情或價格太低，往往做不到適時采收，在不經意中影響了藥材質量。
以上諸例說明中藥材的采收季節性是很嚴格的。因此，做到適時和合理的采收中藥材，是關系到中藥品質優劣、有效成分含量的高低以及保護和擴大藥材資源的關鍵問題，必須引起重視。合理采收中藥材，不但與采收時間有關，而且與藥用植物的種類、供藥用的部位以及有效成分含量的變化等也有密切關系。因此，合理、適時采收中藥材不僅要考慮到單位面積的產量，而且還要了解藥植生長發育特性、生長年限、有效成分積累變化規律以及加工方法等條件，才能達到優質高產之目的。
中藥材初步加工
有不少藥材采挖后需要進行初加工，如：白芷，采挖后需趁鮮用硫磺熏十幾個小時，這樣可以縮短晾曬時間，可是，熏過的白芷硫磺明顯超標。還有的藥材在加工飲片時用水長時間侵泡，如：金蕎麥，在加工飲片前倒進水池里浸泡8-10個小時。長時間浸在水里，難道有效含量不流失。
中藥材產地初加工不科學不規范，傳統的加工模式，造成中藥材質量降低。近幾年在國家嚴管的壓力下，有不少藥材初加工改用了汽蒸或者電炕烘干，避免了有效含量流失和硫磺超標。
中藥材炮制不規范
中藥必須經過炮制之后才能入藥，是中醫用藥的特點之一。中藥炮制是根據中醫藥理論，依照辨證施治用藥的需要和藥物自身性質，以及調劑、制劑的不同要求所采取的制藥技術。
有的加工戶為了降低炮制成本，該用蜜制的不用蜂蜜，反而用糖代替，需要蜜制的藥材有甘草、款冬花、枇杷葉等。需要用醋炮制的藥材元胡、甘遂、柴胡等，有的加工戶不用正宗的醋，改用醋精。
中藥材炮制需凈選加工，根據具體情況，進行挑、選、篩選、風選、水選、剪、切、刮、削、剝、刷、擦、燙、撞等方法，以達到凈度要求。有的加工戶為節省時間，往往省去許多加工環節，或經過簡單地挑選水洗就直接炮制。
中藥材炮制不規范，偷工減料，或用價格低廉的輔料，如此，怎能保證藥材質量。
中藥材儲藏不當
中藥材采收加工后，應及時進行包裝、儲藏。在儲藏保管中，常會發生霉爛、蟲蛀、變色、泛油等現象而導致藥材變質，影響或失去療效。如儲藏不當，不僅失去了療效，而且服后還有毒副作用。
在中藥材儲藏過程中，為防治霉變、蟲蛀，不少人采取硫磺熏，或者放進磷化鋁殺蟲。尤其在夏季，十天半月熏一次磺，或者用磷化鋁殺蟲。整個夏季，往往需要熏磺5-6次，磷化鋁殺蟲2-3次。
為了保障藥材質量，近幾年藥商多把藥材放在冷庫儲藏。 中藥材的合理儲藏對保證藥材的品質，有著重大意義。因此必須儲存保管好，以保證其質量和藥效。
銷售
在中藥材銷售過程中一些不法商販為了謀取更大利潤，往往進行造假摻假行為。較常見的就是在飲片中摻加重粉，還有用外形類似的偽品充當正品（多指飲片），也有的把藥廠提取過有效成分的藥材摻入正品中出售等等。造假者千方百計，研究一系列造假方法，可謂是花樣百出、魚目混珠，讓人真假難辨。
總之，中藥材從種植管理，采收加工，到炮制、儲藏以及銷售過程中，人為的有意的無意的導致中藥材質量下降，都是影響藥材有效成分及質量的罪魁禍首。
